Первый ботанический сад был заложен в начале XIV века Маттео Сильватико (итал. Matteo Silvatico, лат. Matthaeus Silvaticus) при Scuola medica salernitana в Салерно. В 1333 устроен медицинский и ботанический сад в Венеции. С этого времени богатые итальянские города соперничают между собой в устройстве ботанических садов. Наибольшей известностью в XVI и XVII веках пользовались ботанические сады в Ферраре, Падуе, Пизе, Болонье, Неаполе и Флоренции. Во Франции первый ботанический сад основан в Монпелье в конце XVI века. В Париже в 1627 лейб-медик Ги де ла Бросс преобразовал устроенный в 1597 дворцовый сад в ботанический. В Нидерландах в 1577 основан академический ботанический сад в Лейдене, позже в Амстердаме (с 1646 - один из богатейших в Европе). Новую эпоху в истории ботанических садов в XVIII веке открыл ботанический сад лорда Клиффорта в Гардекампе, около Хаарлема, под управлением Линнея. В Англии в XVII веке был основан королевой Елизаветой сад в Кью (Kew); позже устроены сады в Челси, Элтаме. Английские ботанические сады всегда считаются одними из богатейших в мире. В Германии в 1580 основан ботанический сад в Лейпциге, в 1587 в Бреславле, в 1597 в Гейдельберге. В конце XIX века ботанический сад имелся при каждом германском университете. Кроме упомянутых, славились ботанические сады: в Германии - в Берлине, Галле, Мюнхене, Штутгарте, Бельведерский около Веймара, в Дике около Дюссельдорфа, в Австрии - Шёнбруннский в Вене, в Швеции - Упсальский и Лундский. В России первый ботанический сад основан в 1714 Петром I в Санкт-Петербурге под названием Аптекарского огорода. В первой четверти XVIII века были устроены ботанические сады в Москве (графом А. Разумовским), Дерпте и Вильне.

древний Вавилон, сады Семирамиды.